Fluoreszenzfarbstoffe werden in vielen biologischen Bereichen angewendet. Dabei ist wichtig, dass die Farbstoffe in die nachzuweisenden Strukturen an- oder eingelagert werden. Nach Anregung mit kurzwelligem Licht kann die längerwellige Fluoreszenz Aufschlüsse auf die chemische Natur der Probe geben. So können mit ihrer Hilfe wichtige Zellbestandteile selektiv angefärbt und so frühzeitig Veränderungen festgestellt werden, was vor allem in der Medizin von großer Bedeutung ist.